Участники программы ИТ-ипотеки могут дополнительно снизить процентную ставку по кредиту за счёт бюджета регионов. Такая возможность предусмотрена во всех регионах, участвующих в программе — кроме Москвы и Санкт-Петербурга, на которые с августа 2024 года она не распространяется.